非学历继续教育主要开展各类面向政府、企业和社会人士的继续教育、干部培训和职业培训等项目。复旦大学现已形成多层次、多形式的非学历继续教育培训体系。现各类培训项目一年1000余个、接受培训人数11万余人次。
复旦大学教育培训网站：https://fdpx.fudan.edu.cn/
复旦大学非学历教育管理办公室
2006年，学校设立“复旦大学非学历教育管理办公室”，挂靠继续教育学院，负责全校各类非学历教育项目的管理与服务。
全国干部教育培训复旦大学基地
2009年，中组部、教育部联合发文，批准复旦大学等十三所高校为全国干部教育培训高校基地。复旦大学组建了基地领导小组，设立了基地办公室，挂靠继续教育学院，负责干部教育培训基地的建设、管理、服务与日常事务。全国干部教育培训复旦大学基地承担面向全国各级组织部门、政府机构和大型企事业单位等委托的干部培训任务。基地依托学校学科多、师资强的综合优势和上海地处全国改革开放前沿的区域优势，形成了具有复旦特色的培训项目和运行模式，建立起一支由校内外专家学者、政府机构主管和企业高管共同组成的高素质师资队伍，建设了一批干部培训教育亟需的，受到广泛好评的高质量课程，树立了全国干部教育培训的复旦品牌和地位。
国家级继续医学教育基地
复旦大学是卫生部认定的国家级继续医学教育基地，承担各类医学继续教育培训项目。
